10xGenomics-单细胞转录组测序

1. 技术原理

10x Genomics chromium 平台可以在单细胞水平对每个细胞内的 mRNA 进行检测，通过大量的单细胞基因表达数据，可进行细胞表达特征聚类、亚群表达特征分析、细胞分化轨迹、细胞间互作关系等方面的研究。

10x Genomics 单细胞转录组技术基于微流体平台，将带有条形码和引物的凝胶珠和单个细胞包裹在油滴中;在每个油滴内，凝胶珠溶解，细胞裂解释放 mRNA，通过逆转录产生带条形码的CDNA;液体油层破坏后，CDNA后续进行文库构建，然后使用 川umina 测序平台对文库进行测序检测，即可一次性获得大量单细胞的基因表达数据，从而实现在单细胞水平进行转录组测序的目的。


10x Genomics 单细胞转录组检测平台及原理


10xGenomics 单细胞基因表达 Fle技术基于 10xChromium X 高通量平台,使用探针杂交的方式捕获靶基因，结合，通过配套专用芯片的微流控通道，与含有 Barcode 的凝胶珠被油滴包裹形成油包水结构的微(Gel beads)体系(GEMs);GelBeads 上的引物序利用 lllumina 测序平台进行测列与探针序列杂交，批量扩增形成测序文库序，获得大量单细胞的基因表达数据。司时，Flex技术也实现了对 FFPE样本的身细胞水平测序研究，解锁大量储存在医院以及生物样本库中的 FFPE样本的宝贵信息。


10x Chromium X平台及单细胞基因表达Flex工作流程


2. 平台优势

  • 通量高：每个样本可获取 10000个细胞
  • 周期短：2 天内即可完成悬液制备、细胞捕获及建库
  • 经验丰富：博奥晶典已完成2万+样品，150+组织类型，包括 FFPE 样本的单细胞水平测序
  • 实验质量认证：博奥晶典单细胞转录组测序已获得 10xGenomics 官方 CSP 认证证书
  • 一站式服务：博奥晶典提供从样品处理到数据可视化一站式服务

3. 应用方向

  • 肿瘤研究
  • 疾病机制
  • 干细胞研究
  • 衰老发育
  • 免疫研究
  • 植物研究
  • 神经科学
  • 药物研究