全国唯一 | 博奥晶典空间转录组测序技术荣获CSP官方认证
日期:2020-09-15 来源:

       日前,北京博奥晶典生物技术有限公司空间转录组测序技术荣获10x Genomics公司颁发的CSP证书,这是继单细胞转录组测序、单细胞ATAC测序技术、单细胞免疫组库之后博奥晶典获得的又一官方认证,是全国唯一一家同时拥有四种10x平台测序技术官方认证的服务商。

       作为国内首批引进10x Genomics单细胞平台的公司,博奥晶典拥有系统完善的单细胞测序服务平台,涵盖了单细胞转录组、空间转录组测序、单细胞免疫组库、单细胞ATAC、单细胞蛋白等多种分子水平的单细胞服务实验。涉及的研究领域包括肿瘤、免疫、发育、神经、再生等。

单细胞转录组测序

       单细胞转录组测序可以在单细胞水平分析基因表达,研究细胞的异质性,定义细胞类型,识别细胞状态,探索新的细胞亚群和稀有细胞群,具有广泛的应用潜力。

图1 细胞分群图(左) 图2 拟时间序列图(右)

空间转录组测序

       空间转录组测序可以从一片完整的冰冻组织切片中获取切片不同位置细胞中的转录组数据,其基因表达的位置信息对于理解组织功能和病理变化具有重要的意义,尤其在肿瘤研究、免疫研究、发育生物学、脑神经学、病理研究等方面极为重要,可应用于多领域研究多种组织空间基因表达的高新技术。

图3 组织切面空间分群可视化结果

单细胞免疫组库测序

       单细胞免疫组库作为探索生物体免疫细胞多样性变化的技术,可探索肿瘤免疫微环境,识别和抵御身体外部的入侵者,描述肿瘤发生机制,辅助免疫治疗;探索自身免疫疾病和炎症性疾病机制,辅助疫苗研究;揭示器官移植带来的排斥反应,为排异药物研究提供帮助,是肿瘤和免疫疾病研究的有力工具。

图4 B细胞克隆型注释(左) 图5 多样本比较分析(右)

单细胞ATAC测序

       单细胞ATAC作为表观遗传学研究技术手段,可用于绘制单细胞基因组染色质开放区的图谱,在单细胞水平研究基因调控区。结合单细胞转录组数据探索基因的转录调控机制,进一步阐述生物现象发生变化的原因。

图6 细胞群预测(左) 图7 转录调控机制(右)

单细胞蛋白测序

       单细胞蛋白测序技术可以同时获得单细胞层面的蛋白和基因表达信息。由于基因与蛋白的表达不一致,了解基因调控和单细胞异质性需要有关RNA和蛋白表达的信息。利用单细胞转录组+蛋白组进行多维组学研究,不仅可以提高解析度,而且两个维度相互验证,使实验结果更具说服力。

图8 单细胞蛋白实验原理

       在单细胞领域,博奥晶典目前已完成4000多个样品、100多种不同样品类型的服务,覆盖的物种和样品类型包括人和小鼠的肝脏、肺脏、皮肤、心脏、脑、肾脏、血液、卵巢、神经,以及鸡、斑马鱼、猪、水稻、拟南芥、油菜、白菜、橄榄等,是目前国内大规模单细胞测序经验丰富的公司。且已累计支持客户发表单细胞高分文章21篇,影响因子291.627分,是目前国内支持发文最多、累计影响因子最高的公司。

博奥晶典支持发表单细胞测序文章(部分)

✦ 博奥晶典目前可开展以下单细胞测序产品和服务: