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博奥晶典单细胞表面抗体及转录组测序服务喜获北京市新技术新产品(服务)证书

日期:2020/06/08  来源:

       日前,“北京市新技术新产品(服务)”名单已公示。根据《北京市新技术新产品(服务)认定管理办法》的规定,北京博奥晶典生物技术有限公司“单细胞表面抗体及转录组测序服务”通过北京市新技术新产品认定,喜获由北京市科委、市发展改革委、市经济信息化局等部门联合颁发的北京市新技术新产品(服务)证书。

单细胞表面抗体及转录组测序服务

       “北京市新技术新产品(服务)认定”旨在推动高新技术产业的发展,作为北京市新技术新产品,应拥有自主知识产权,并具有技术先进性和创新性。本次喜获“单细胞表面抗体及转录组测序服务”荣誉证书是各委员会对博奥晶典单细胞产品及服务创新能力的肯定,同时体现了博奥晶典单细胞产品服务在行业内的技术优势。

       至此,博奥晶典科研服务已累计获得12项北京市新技术新产品认定证书。在未来的发展道路上,博奥晶典科研服务将坚持不懈地走好产品服务道路,继续提高产品及服务创新能力,为老师提供更加优质的科研服务。

单细胞表面抗体及转录组测序服务

       近年来,随着单细胞测序技术的发展,单一的单细胞转录组研究已经难以满足对生命功能深入探索的需求。蛋白质作为生命活动的功能执行体,其研究价值越来越受到重视。将单细胞表面抗体及转录组研究结合在一起多维度解读单细胞信息,不仅能够更仔细地观察细胞之间的异质性,同时也能够更清楚地识别特定细胞及其功能,因此已经成为单细胞多组学研究的新热点, 对于研究疾病机制、进展、诊断和治疗方法等均具有重要意义,可以指导临床转化。

应用方向:肿瘤免疫治疗

       2019年12月,Nature Medicine发表对免疫检查点治疗效果好和不好的5种癌症类型,共94例患者进行单细胞蛋白和单细胞RNA测序,在多形性胶质母细胞瘤中发现了一个独特的CD73hi巨噬细胞群,在抗PD-1治疗后仍然存在。通过构建CD73敲除鼠发现CD73的缺失提高了抗CTLA-4和抗PD-1治疗的多形性胶质母细胞瘤小鼠模型的存活率。证实CD73是一种特异性的免疫治疗靶点,可提高多形性胶质母细胞瘤免疫检查点治疗的抗肿瘤免疫应答。

图1 胶质母细胞瘤中独特的CD73hi巨噬细胞群[1]

图2 敲除鼠验证CD73的免疫治疗靶点功能[1]

       2019年12月,Science Immunology发表对黑色素瘤患者进行单细胞蛋白和单细胞RNA测序,发现肿瘤微环境的变化:巨噬细胞和髓样抑制细胞的促炎性活化的增加,肿瘤内CD8+T细胞中的干扰素-γ表达。GCN2通过促进转录因子CREB-2/Atf4的翻译增加而改变了髓样抑制细胞的功能,其中CREB-2/Atf4是小鼠和人类中巨噬细胞和髓样抑制细胞成熟所必需的,而且利用小干扰RNA靶向Atf4可降低肿瘤生长,揭示免疫肿瘤学潜在的治疗靶点GCN2在肿瘤免疫反应中的作用。

图3 GCN2在黑色素瘤中分布[2]

应用方向:自身免疫疾病

       2019年5月,Nature Immunology报道关于类风湿性关节炎(RA)的研究。作者对来自RA或骨关节炎(OA)患者的51个滑膜组织样品的T细胞、B细胞、单核细胞和成纤维细胞进行单细胞RNA测序(scRNA-seq)、质谱流式检测、 转录组测序(bulk RNA-seq)和普通流式细胞检测。利用基于5,265个scRNA-seq图谱典型相关分析的综合策略,作者鉴定了18个独特的细胞群。通过在单细胞层面对跨数据模态进行整合,精确定义了特定细胞亚群在RA和慢性炎症中的作用。

图4 单细胞转录组和单细胞蛋白检测鉴定RA细胞亚群[3]

图5 质谱流式鉴定OA、RA细胞亚群基因表达[3]

       单细胞转录与单细胞蛋白组联合不仅解决了细胞异质性难题,提供丰富的细胞表型信息,帮助我们更加透彻的了解机体免疫系统的复杂变化,同时也为疾病的靶向治疗及个体化药物研发提供了有力的工具。

       博奥晶典基于10x Genomics和BD RhapsodyTM两大单细胞捕获平台,可同时提供检测单细胞转录组和表面蛋白的服务,为各位老师的科研保驾护航。

图6 单细胞蛋白检测实验流程
参考文献:

[1] Goswami S, Walle T, Cornish A E, et al. Immune profiling of human tumors identifies CD73 as a combinatorial target in glioblastoma. Nature Medicine, 2020, 26(1): 1-8.

[2] Halaby M J, Hezaveh K, Lamorte S, et al. GCN2 drives macrophage and MDSC function and immunosuppression in the tumor microenvironment. Science immunology, 2019, 4(42): 1-17.

[3] Zhang Fan, Wei Kevin, Slowikowski Kamil, et al. Defining inflammatory cell states in rheumatoid arthritis joint synovial tissues by integrating single-cell transcriptomics and mass cytometry. Nature Immunology, 2019, 20: 928-942.

博奥晶典单细胞测序平台

       博奥晶典作为国内第一批引进10x Genomics平台的公司,率先在国内开展上万级通量的单细胞转录组测序服务。目前已经完成了2000多个样品、上百种不同样品类型的服务,覆盖的物种和样品类型包括人和小鼠的肝脏、肺脏、皮肤、心脏、脑、肾脏、血液、卵巢、神经,以及鸡、斑马鱼、猪、水稻、拟南芥、油菜、白菜、橄榄等,是目前国内大规模单细胞测序经验最为丰富的公司。

       博奥晶典于2019年12月同时获得了单细胞转录组、单细胞ATAC、单细胞免疫组库3个服务产品的官方CSP认证,成为国内唯一一家同时获得3项10x单细胞测序服务官方认证的公司。

       博奥晶典支持10x Genomics单细胞转录组测序文章分别发表在CellPNAS、Cell Stem Cell、Cell Reports、Cancer Research、Cell Research、Nature Communications等期刊。至此,博奥晶典已累计支持客户发表单细胞高分文章12篇,影响因子154.479分,是目前国内支持发文最多、累计影响因子最高的公司。





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